AEFJN istnieje od 1988 roku. Jest popierana przez 50 zgromadzeń zakonnych i misyjnych, które działają w Afryce i Europie. Jej misją jest obecność osób konsekrowanych i misjonarzy wszędzie tam, gdzie są podejmowane decyzje polityczne dotyczące relacji ekonomicznych między Afryką i Europą. Wszystko po to, by wspólnie przeciwdziałać niesprawiedliwym relacjom ekonomicznym oraz problemom głodu i zbrojeń wśród narodów Afryki.